Как я понимаю, бонусы получаете вы, но за что? за то что расчитываетесь за товар, или за то что у вас его покупают. Можно ли подробнее?
3310-1210 проводка по закрытию Дт/Кт задолженности. Почему даете проводку Казком-наш покупатель? получается 3 стороны))
Немного не понятно по выписке с банка. 1030-почему р/с Казкома, а не ваш?

Я не уверена, что правильно поняла ситуацию. Если я правильно поняла, то Вы получаете доход в виде бонусов? Тогда, их надо учитывать как доход, используя счета 6 раздела.
Если напишете немного подробнее, то будет легче составить проводки. 

Victoriya
Попыталась разобраться в Вашей ситуации. Эти бонусы у Вас не должны оставаться, они уходят к покупателю, держателю карты. Значит их надо ему начислить и списать. Можно было бы вообще не обращать на них внимание, но для того, что бы сходилось сальдо с Казкомом, Вам приходится вести учет этих бонусов. Предлагаю следующий метод учета:
Стандартные операции
Дт 1210 (Покупатель) Кр 6010 сумма 3000 тенге - документ Реализация товаров.
Дт 1020 (или другой из счетов, какой Вам больше подходит - терминал) Кр 1210 (Покупатель) сумма 3000 тенге - документ Выписка банка.
Дт 1030 Кр 1020 сумма 3000 тенге - документ Выписка банка.
Теперь, предлагаемые мной проводки для начисления и списания бонусов (счета учета можете изменить, если считаете предлагаемые не корректными. главное сам принцип)
Дт 7310 Кр 3380 (Покупатель) сумма 15 тенге Начисли бонусы Покупателю.
Дт 3380 (Покупатель) Кр 1020 (терминал) сумма 15 тенге Оплатили Покупателю бонусы
Дт 1270 (Казком) Кр 6030 сумма 15 тенге Возмещение выплаченных бонусов
Дт 1020 (Терминал) Кр 1270 (Казком) сумма 15 тенге.
Приблизительно так. Ваше мнение?

Курите?.. Ну-ну...
Источник - http://www.gocard.kz/site/index.php

Из чего следует, что кредит и бонусы предоставляет Казкоммерцбанк. Но... Кредит Казкоммерцбанка, а бонусы за счет предприятия... Довольно удобная схема для предприятий торговли из-за возможности увеличения товарооборота.
Насколько я понял Викторию, ей необходимо чтобы и реализация и оплата и р/с и бонусы были взаимосвязаны...
1210 (Покупатель, Без договора) - 6010 (Доход от реализации, Товар, Магазин) = 10000 - реализация
1210 (Покупатель, Без договора) - 3130 (НДС, Налог/взнос начислено/уплачено) = 1300 - НДС
7110 (Магазин, Текущие расходы) - 3310 (Казкоммерцбанк, Договор) = 565 - бонус (из расчета 5% )
1030 (Р/с, Реализация товаров) - 3398 (Казкоммерцбанк, Договор) = 10735 - оплата
3398 (Казкоммерцбанк, Договор) - 1210 (Покупатель, Без договора) = 10735 - зачет оплаты
3310 (Казкоммерцбанк, Договор) - 1210 (Покупатель, Без договора) = 565 - зачет бонуса

Поправьте, если что-то пропустил...

Victoriya
Вы не расстраивайтесь раньше времени. Уже разобрались кое в чём, разберёмся и дальше. Москва не сразу строилась (С). 
Я не правильно поняла схему начисления бонусов. Я думала, что бонусы начисляет ККБ за свой счет, а получается, что за Ваш. Спасибо господину Cleaner    Теперь будем рассматривать с этой стороны.
Насколько я поняла, это Ваша система скидок, осуществляемая ККБ?

И ещё хотела уточнить, покупатель Вам может оплатить только "Вашими" бонусами, или полученными у другого партнера тоже?

Правильно. Это обычная скидка:
Дт 1210
  Кт 6010-10 000
(не беру НДС-мешает только)
Дт 1030-9774
Дт 6030-226
   Кт 1210-10 000

Скажите, какие деньги вы ждете от ККБ в случае, когда покупатель желает воспользоваться бонусом при покупке? Что происходит? Он дает карту, на которой есть деньги+бонус, вы снимаете с карточки стоимость товара, дальше? Что?

Таак. К зачислению-0, но потом происходит перечисление на р/с, и как сказано выше, на сумму реализации минус бонус, минус комиссия.

Я правильно поняла?

По логике, они не будут попадать на расчетный счет. Я о бонусах.

Еще раз по схеме (что-то с соображалкой у меня уже как 3-тий день проблема)
1. Покупатель оплачивает товар.
Продавец получает оплату через терминал на расчетный счет, но за минусом начисленного бонуса.
2. Банк зачисляет бонусы, удержанные у продавца, на карт-счет покупателя.
3.Покупатель использует карточку на котором есть и ДС и бонус для покупки товара в любой точке, где есть терминал банка.

Что делает продавец.
Продавец продает товар, но поскольку деньги за него поступают не в полной сумме, а со скидкой(я все-таки так буду называть), у себя он учитывает эту скидку при реализации.
Что делает банк.
Он удерживает (не доплачивает) скидку продавцу, но возвращает сумму бонуса на карт-счет покупателя.
Что делает покупатель.
Покупатель использует бонусы при следующей покупке.
Но при этом снова получает определенную скидку при покупке, или же бонус.

Так?

Думаю, не совсем так... Мне больше нравится:
1210 (Покупатель, Без договора) - 6010 (Доход от реализации, Товар, Магазин) = 10000 - реализация
1210 (Покупатель, Без договора) - 3130 (НДС, Налог/взнос начислено/уплачено) = 1300 - НДС
7110 (Магазин, Текущие расходы) - 3310 (Казкоммерцбанк, Договор) = 11300 - бонус (реализация за счет бонусов)
3310 (Казкоммерцбанк, Договор) - 1210 (Покупатель, Без договора) = 11300 - зачет бонуса
а) нет необходимости учитывать бонусы (да и не Ваши они...)
б) нет необходимости учитывать бонусы других продавцов

Ну какая же это скидка... Это расходы по реализации (7110)

Тогда делите бонусы на комиссию и непосредственно бонус.
Думаю, так. (с) Винни-Пух

Есть такая фишка в этой программе. За покупки начисляются бонусы и держатель карточки может приобретать товары на сумму бонусов. Тогда он говорит при покупке, чтобы сумму за товары сняли за счет бонусов.

Не совсем... Бонус от продавца, но по программе Казкоммерцбанка... Да и скидкой это не назовешь, поскольку цена товара не уменьшается, а просто начисляются деньги (довольно виртуальные) за покупку. Реальными деньгами их не назовешь, поскольку их можно потратить только на покупку товара. Причем бонусы может начислять один продавец, а отдуваться за них - другой.